RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 EPHA3P29320 983 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ARRB2P32121 409 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TAZQ16635 292 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PIGGQ5H8A4 983 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TMEM110Q86TL2 294 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZNF516Q92618 1163 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZNF597Q96LX8 424 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 WRNIP1Q96S55 665 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 VPS28Q9UK41 221 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 EMCNQ9ULC0 261 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TBX20Q9UMR3 447 aa22.42■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BMP10O95393 424 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MS4A2Q01362 244 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KCNC4Q03721 635 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NIPA2Q8N8Q9 360 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 K7EPI3 171 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 INHBBP09529 407 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DCAF6Q58WW2 860 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NANOGP8Q6NSW7 305 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TMEM270Q6UE05 265 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DLG3Q92796 817 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ARMC7Q9H6L4 198 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BTG4Q9NY30 223 aa22.41■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ABCA3Q99758 1704 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SERPINE1P05121 402 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 KCNA4P22459 653 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 FSCBQ5H9T9 825 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 C16orf46Q6P387 395 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SCAIQ8N9R8 606 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CCDC17Q96LX7 622 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NYAP2Q9P242 653 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CHADO15335 359 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CD1EP15812 388 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PPP2R5DQ14738 602 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 TRIM50Q86XT4 487 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HM13Q8TCT9 377 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 CDRT15Q96T59 188 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 HIPK3Q9H422 1215 aa22.4■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 BAIAP3O94812 1187 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NUDT2P50583 147 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 UBXN2AP68543 259 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 NRF1Q16656 503 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 WDR44Q5JSH3 913 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.39■■□□□ 1.18
OPN3-201ENST00000366554 AIM2O14862 343 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 APOEP02649 317 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 C21orf59P57076 290 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 GSDMBQ8TAX9 411 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.39■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 PCLAFQ15004 111 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 ZBED5Q49AG3 693 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 NIPAL1Q6NVV3 410 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 C16orf89Q6UX73 402 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 GPR141Q7Z602 305 aa22.38■■□□□ 1.17
OPN3-201ENST00000366554 DSELQ8IZU8 1212 aa22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms