RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCAM1P13591 858 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP11B1P15538 503 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT9P35527 623 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPIFB4P59827 614 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 BEND5Q7L4P6 421 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO10Q9UK96 956 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCN2Q9UL51 889 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFRA2O00451 464 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRO43593 1189 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 LATS1O95835 1130 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CISD3P0C7P0 127 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1A3P13637 1013 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIE1P35590 1138 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 RING1Q06587 406 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYCP1Q15431 976 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAC4Q86UU9 113 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB11Q96P15 392 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC10BA6NIK2 292 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRRT4C9JH25 899 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGK1O00141 431 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 APBB3O95704 486 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERBB2P04626 1255 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNR2P34972 360 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DGKGP49619 791 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBX4P57082 545 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAM2P57087 298 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF5Q15542 800 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM32Q8TC27 787 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOX5Q96PH1 765 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.37■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM23O75077 832 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-25P01717 112 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYBBP04839 570 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NNTQ13423 1086 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRY1Q16526 586 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF3Q5VWG9 929 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A13Q96H72 371 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP83Q9Y592 693 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN9O14815 690 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 AXIN1O15169 862 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN3O60637 253 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF445P59923 1031 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBXN1Q04323 297 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPPE1Q53F39 396 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EOGTQ5NDL2 527 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRF1Q5T601 910 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms