RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312280.7

PMP22-201, Transcript of peripheral myelin protein 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PMP22, Length 1,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22-201ENST00000312280 DPH5Q9H2P9 285 aa15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 RAB21Q9UL25 225 aa15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PMP22-201ENST00000312280 LIASO43766 372 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GBP1P32455 592 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CLCN6P51797 869 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CAMK1Q14012 370 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 EFHC2Q5JST6 749 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 MIB1Q86YT6 1006 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 JAMLQ86YT9 394 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 FAM71BQ8TC56 605 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TTLL2Q9BWV7 592 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.96■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 HMBSP08397 361 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TAF12Q16514 161 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZNF670Q9BS34 389 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SIK2Q9H0K1 926 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TLR9Q9NR96 1032 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.95■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 APOL1O14791 398 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 DAPK3O43293 454 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 FNTAP49354 379 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 WDR93Q6P2C0 686 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 LILRA6Q6PI73 481 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 PLD5Q8N7P1 536 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 NTAN1Q96AB6 310 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 FAF2Q96CS3 445 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GDF3Q9NR23 364 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 COMMD8Q9NX08 183 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 LAMA3Q16787 3333 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TLR5O60602 858 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ECEL1O95672 775 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CSH1P0DML2 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CSH2P0DML3 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ETS1P14921 441 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ARL4AP40617 200 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CREMQ03060 361 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GPR65Q8IYL9 337 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ATL2Q8NHH9 583 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TMEM121Q9BTD3 319 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 CLIC5Q9NZA1 410 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 STK39Q9UEW8 545 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 LZTS1Q9Y250 596 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SNX24Q9Y343 169 aa15.94■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SLC12A8A0AV02 714 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ADH1AP07327 375 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 VPS41P49754 854 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 EPHB3P54753 998 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TBX4P57082 545 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 GBE1Q04446 702 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 TFDP2Q14188 446 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 VEPH1Q14D04 833 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 PPP1R7Q15435 360 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 SLC9A4Q6AI14 798 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMP22-201ENST00000312280 IFT20Q8IY31 132 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms