RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281187.9

VPS26B-201, Transcript of VPS26, retromer complex component B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPS26B, Length 3,691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26B-201ENST00000281187 DGKZQ13574 1117 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 EXT2Q93063 718 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SLIT2O94813 1529 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ERVK-10P10266 1014 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 THRAP10827 490 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 TNFSF9P41273 254 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 JAG1P78504 1218 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 WASHC5Q12768 1159 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 RELL1Q8IUW5 271 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF358Q9NW07 568 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 PTTG2Q9NZH5 202 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SAC3D1A6NKF1 404 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 PTK2BQ14289 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 RCN3Q96D15 328 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 COL20A1Q9P218 1284 aa14.65□□□□□ -0.06
VPS26B-201ENST00000281187 ADCY6O43306 1168 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NAA20P61599 178 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SULF1Q8IWU6 871 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CYLDQ9NQC7 956 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 A0A088AWK7 358 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GPD1P21695 349 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PSMD7P51665 324 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TCEAL1Q15170 157 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 LRRC38Q5VT99 294 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GIPC3Q8TF64 312 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MGAT1P26572 445 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GRIA1P42261 906 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 KDELC2Q7Z4H8 507 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 GPR141Q7Z602 305 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CGRRF1Q99675 332 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.64□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CRTAMO95727 393 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CCNE2O96020 404 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 AMHP03971 560 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 P4HA1P13674 534 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ADRA2BP18089 450 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NME5P56597 212 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 CBX3Q13185 183 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 LPIN1Q14693 890 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ANO4Q32M45 955 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 COG4Q9H9E3 785 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZNF302Q9NR11 478 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 EURLQ9NYK6 297 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TMX2Q9Y320 296 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 NR1H2P55055 460 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 HPCAP84074 193 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TLR1Q15399 786 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 SLC39A4Q6P5W5 647 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.63□□□□□ -0.07
VPS26B-201ENST00000281187 TMC7Q7Z402 723 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms