RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 USP12O75317 370 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HSMCR30P0CW71 290 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF333Q96JL9 665 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 INTS13Q9NVM9 706 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATF6P18850 670 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATP6V1B2P21281 511 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GCLMP48507 274 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RHAGQ02094 409 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RAD51Q06609 339 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM270Q6UE05 265 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF570Q96NI8 536 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CDRT15Q96T59 188 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ITIH1P19827 911 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NNMTP40261 264 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IQCKQ8N0W5 287 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 E9PBE3 544 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TPBGLP0DKB5 382 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GNG2P59768 71 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf88Q6PI97 169 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA33Q96N06 139 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM9Q9C026 710 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C2CD2LO14523 706 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GRIN3BO60391 1043 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SHBGP04278 402 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FYNP06241 537 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RALAP11233 206 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SOX11P35716 441 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 AMPD2Q01433 879 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 UGP2Q16851 508 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ERO1BQ86YB8 467 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MAF1Q9H063 256 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PTGES3LE9PB15 166 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TEX28O15482 410 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MMP13P45452 471 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 MROH9Q5TGP6 573 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 UCMAQ8WVF2 138 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF609O15014 1411 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SPTLC1O15269 473 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 DDR2Q16832 855 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TLR10Q9BXR5 811 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 THAP1Q9NVV9 213 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 GSC2O15499 205 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 HOXC6P09630 235 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT17P0C025 328 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 FDFT1P37268 417 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 CASP4P49662 377 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 STAT5BP51692 787 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 YME1L1Q96TA2 773 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 S100A14Q9HCY8 104 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 OSTNP61366 133 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 RBP5P82980 135 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 VEPH1Q14D04 833 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 ULK4Q96C45 1275 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRO-201ENST00000281171 KRT87PA6NCN2 255 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms