RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 PWWP2AQ96N64 755 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CGRRF1Q99675 332 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 IFT52Q9Y366 437 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ENTPD5O75356 428 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 KRT1P04264 644 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SPDYE6P0CI01 402 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 KRT5P13647 590 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SCNN1DP51172 638 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 PEX3P56589 373 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SNAP25P60880 206 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CHRNEQ04844 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SPP2Q13103 211 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CYTH1Q15438 398 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SATL1Q86VE3 508 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CPT1BQ92523 772 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CYTH2Q99418 400 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 NPHS2Q9NP85 383 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 MAFFQ9ULX9 164 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 SNX2O60749 519 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TM7SF2O76062 418 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 GIPC3Q8TF64 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF516Q92618 1163 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 A0A1W2PPM1 405 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TBX10O75333 385 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 C1QAP02745 245 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 PHKA2P46019 1235 aa6.5□□□□□ -1.37
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SGIP1-201ENST00000237247 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 CCDC6Q16204 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 C4orf22Q6V702 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SGIP1-201ENST00000237247 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.5□□□□□ -1.37
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