RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	RINL	Q6ZS11	566 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	INPP5D	Q92835	1189 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	IRF6	O14896	467 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CLGN	O14967	610 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D12	O60347	775 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TPST1	O60507	370 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2C8	P10632	490 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC1A6	P48664	564 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PRAME	P78395	509 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	FSCB	Q5H9T9	825 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC38	Q5VT99	294 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	IFNE	Q86WN2	208 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	DDIT4	Q9NX09	232 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NENF	Q9UMX5	172 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ADM5	C9JUS6	153 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525		M0QZ92	97 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	JCHAIN	P01591	159 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ETS2	P15036	469 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	GOT1	P17174	413 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	GMPR	P36959	345 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NME5	P56597	212 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	APPL2	Q8NEU8	664 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	REPS2	Q8NFH8	660 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	BTBD7	Q9P203	1132 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CLUH	O75153	1309 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TPP1	O14773	563 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	MYL3	P08590	195 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TPBGL	P0DKB5	382 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP4A	P20648	1035 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CA9	Q16790	459 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ACAD11	Q709F0	780 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	XYLT1	Q86Y38	959 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CENPK	Q9BS16	269 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NACA2	Q9H009	215 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PNPO	Q9NVS9	261 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	GIPC1	O14908	333 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS20	O76081	388 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	CA8	P35219	290 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PKNOX1	P55347	436 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB106A	Q8N104	65 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	C10orf82	Q8WW14	230 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	EBF4	Q9BQW3	602 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJC6	O75061	913 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	PSMB4	P28070	264 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	SERPINB9	P50453	376 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-223	ENST00000639525	HASPIN	Q8TF76	798 aa		12.13	□□□□□ -0.47

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