RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACOT1Q86TX2 421 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SULF1Q8IWU6 871 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS52Q8N1B4 723 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX9Q8N6V9 391 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 E2F7Q96AV8 911 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNX27Q96L92 541 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NME7Q9Y5B8 376 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLXNB2O15031 1838 aa9.96□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIP11Q15643 1979 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCN1AP35498 2009 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 I3L4J1 428 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PIK3R2O00459 728 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAGEC1O60732 1142 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALDH1A2O94788 518 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BPGMP07738 259 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSH1P0DML2 217 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CSH2P0DML3 217 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RARBP10826 455 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MYL2P10916 166 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NEFHP12036 1026 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ACADSBP45954 432 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAP1GDS1P52306 607 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB16Q05516 673 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BST1Q10588 318 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTM1Q13496 603 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BLMHQ13867 455 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAF11Q15544 211 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TEX44Q53QW1 395 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAXCQ5TGI0 409 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RINLQ6ZS11 566 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPH6Q7L8W6 267 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 STRADAQ7RTN6 431 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 C12orf29Q8N999 325 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BEST2Q8NFU1 509 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC8Q8TAM2 541 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 HSFY1Q96LI6 401 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 KATNBL1Q9H079 304 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 DONSONQ9NYP3 566 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 USP3Q9Y6I4 520 aa9.95□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 HMX2A2RU54 273 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 A6NJR5 290 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 UNCXA6NJT0 531 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPN14A8MX76 684 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPEF2O14830 753 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GYG2O15488 501 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 UGT1A9O60656 530 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NPTXRO95502 500 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 APRTP07741 180 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP6V1C1P21283 382 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 BCAT1P54687 386 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC42EP1Q00587 391 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GBE1Q04446 702 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 WASHC5Q12768 1159 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NAA25Q14CX7 972 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 TBCCQ15814 346 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 GRIK4Q16099 956 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.94□□□□□ -0.82
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.94□□□□□ -0.82
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