RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 LGSNQ5TDP6 509 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ARCQ7LC44 396 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CATSPER4Q7RTX7 472 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DPP9Q86TI2 863 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FUKQ8N0W3 1084 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC39Q96DD0 335 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 RTP4Q96DX8 246 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PAFAH2Q99487 392 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MEN1O00255 615 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 INHBAP08476 426 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TAC1P20366 129 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GCAP28676 217 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 NR2C2P49116 596 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP1BP68106 108 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GRB14Q14449 540 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DBN1Q16643 649 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MOB2Q70IA6 237 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 UBA3Q8TBC4 463 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF398Q8TD17 642 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM172AQ8WUF8 416 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 FAF2Q96CS3 445 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF157Q96PX1 679 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX25Q9H3E2 840 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ECT2Q9H8V3 914 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CNTN3Q9P232 1028 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 NRCAMQ92823 1304 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNN4O15554 427 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP9BO43861 1147 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAG7O75391 227 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM63AO94886 807 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 UBOX5O94941 541 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MT-ND3P03897 115 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CD48P09326 243 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CREB1P16220 341 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT4P19013 534 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEA6P43360 314 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 RASSF2P50749 326 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GDF10P55107 478 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 GPX6P59796 221 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SARNPP82979 210 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 RIPK1Q13546 671 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNJ11Q14654 390 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL15Q16663 113 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 CDO1Q16878 200 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SV2CQ496J9 727 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 DLK2Q6UY11 383 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms