RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 TMPRSS12Q86WS5 348 aa22.96■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.93■■□□□ 1.26
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CAPNS1-205ENST00000588780 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-205ENST00000588780 OSER1Q9NX31 292 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-205ENST00000588780 NAGPAQ9UK23 515 aa22.9■■□□□ 1.26
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