RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CLDN23	Q96B33	292 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CWH43	Q9H720	699 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TSPY2	A6NKD2	308 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	OPHN1	O60890	802 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	BCAR3	O75815	825 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PCDH8	O95206	1070 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	GNAT2	P19087	354 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	BPIFB4	P59827	614 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	GPC5	P78333	572 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PHC1	P78364	1004 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	RIN1	Q13671	783 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	NEDD9	Q14511	834 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	BROX	Q5VW32	411 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TSSK4	Q6SA08	328 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	NME8	Q8N427	588 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	UBR7	Q8N806	425 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PXMP2	Q9NR77	195 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	RGS18	Q9NS28	235 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	STK39	Q9UEW8	545 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	FRY	Q5TBA9	3013 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MYH1	P12882	1939 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ANHX	E9PGG2	379 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB11FIP3	O75154	756 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CLSTN1	O94985	981 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF806	P0C7X5	589 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	LAMP2	P13473	410 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	KLRC2	P26717	231 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	SP2	Q02086	613 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	PPFIA1	Q13136	1202 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	USH1G	Q495M9	461 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	METTL7B	Q6UX53	244 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	VPS52	Q8N1B4	723 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRC43	Q8N309	656 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TBC1D5	Q92609	795 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	USP7	Q93009	1102 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MYADM	Q96S97	322 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ADAM2	Q99965	735 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	ABCB11	O95342	1321 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-223	ENST00000553686	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		6.66	□□□□□ -1.34

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