RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	MSH4	O15457	936 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	KLRK1	P26718	216 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TM4SF4	P48230	202 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CYP24A1	Q07973	514 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CLIC6	Q96NY7	704 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FZD1	Q9UP38	647 aa		11.02	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	DGKG	P49619	791 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF609	O15014	1411 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TNF	P01375	233 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	HIC1	Q14526	733 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SCLY	Q96I15	445 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CAPN10	Q9HC96	672 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	KATNA1	O75449	491 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	RARG	P13631	454 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	GPC1	P35052	558 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	OCA2	Q04671	838 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PTPRN2	Q92932	1015 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ALPI	P09923	528 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CASP14	P31944	242 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PNKP	Q96T60	521 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ALPP	P05187	535 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	GRK2	P25098	689 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SPAST	Q9UBP0	616 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PSME2	Q9UL46	239 aa		11.01	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SMAP	O00193	183 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PYGB	P11216	843 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ATP6V1C1	P21283	382 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	IDS	P22304	550 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PLGLB1	Q02325	96 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FOXM1	Q08050	763 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CENPP	Q6IPU0	288 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	MKL1	Q969V6	931 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SLIT3	O75094	1523 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	GSAP	A4D1B5	854 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	GHRHR	Q02643	423 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	RALGDS	Q12967	914 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	USP28	Q96RU2	1077 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	OR10G6	Q8NH81	332 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	GDF3	Q9NR23	364 aa		11	□□□□□ -0.65
MARF1-205	ENST00000548025	MRGBP	Q9NV56	204 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms