RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TRPC3	Q13507	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR24	Q96S15	920 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308		E7EVH7	732 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TOR1B	O14657	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP21A2	P08686	494 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGAL	P20701	1170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	UQCRC1	P31930	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR7	P34969	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT9	P35527	623 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SATB1	Q01826	763 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SP2	Q02086	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	XDH	P47989	1333 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GPANK1	O95872	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ERBB2	P04626	1255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP5	P22003	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PTGS2	P35354	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFV1	P49821	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GATM	P50440	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PGD	P52209	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	VAMP2	P63027	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CCNI	Q14094	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	E2F2	Q14209	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD2	Q14681	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	AFAP1	Q8N556	730 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	HAS1	Q92839	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNHG1-222	ENST00000545308	MNT	Q99583	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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