RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 WDR64B1ANS9 1081 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ABCB4P21439 1286 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ANXA13P27216 316 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GCLMP48507 274 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 PPATQ06203 517 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SLC1A5Q15758 541 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TTC7BQ86TV6 843 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC138Q96M89 665 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ACCSQ96QU6 501 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 WHRNQ9P202 907 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 WDR81Q562E7 1941 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0G2JND7 137 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8IPA6NC78 632 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CAPN8A6NHC0 703 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GOLGA8JA6NMD2 632 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CENPBD1B2RD01 187 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SORBS3O60504 671 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 B4GALT4O60513 344 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 KRT75O95678 551 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 P4HA1P13674 534 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CHKAP35790 457 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ETV3P41162 512 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GALCP54803 685 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 PSMC5P62195 406 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 PPP3CAQ08209 521 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TRIP10Q15642 601 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 RGS21Q2M5E4 152 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CDONQ4KMG0 1287 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf19Q8IY42 314 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GIPC2Q8TF65 315 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 28.6
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TRPS1-209ENST00000519674 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 APPL1Q9UKG1 709 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CLOCKO15516 846 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TYROBPO43914 113 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 LYPLA2O95372 231 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 TGDSO95455 350 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CRTAMO95727 393 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CRYZL1O95825 349 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 PTPRAP18433 802 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 BDNFP23560 247 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 VAMP7P51809 220 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 SOX10P56693 466 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-209ENST00000519674 TAMM41Q96BW9 452 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 HAUS8Q9BT25 410 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 FCHO1O14526 889 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 NR3C2P08235 984 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 CPA2P48052 419 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-209ENST00000519674 GTF2BQ00403 316 aa8.74□□□□□ -1.01
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