RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513134.5

TMA16-208, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 3 BASIC

Gene TMA16, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-208	ENST00000513134	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TRIO	O75962	3097 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134		A0A087X0T9	212 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GPR37L1	O60883	481 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RTN2	O75298	545 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	DAB1	O75553	588 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ENDOD1	O94919	500 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CALB1	P05937	261 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FAM228B	P0C875	321 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ARSA	P15289	507 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CDC25B	P30305	580 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	NOS2	P35228	1153 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	DCAF6	Q58WW2	860 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TMC6	Q7Z403	805 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CNGA4	Q8IV77	575 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PLD4	Q96BZ4	506 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	EBF3	Q9H4W6	596 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ECT2	Q9H8V3	914 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134		M0R296	226 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CAPN9	O14815	690 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GRAP2	O75791	330 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	LATS1	O95835	1130 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FECH	P22830	423 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RRM1	P23921	792 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FLT3	P36888	993 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TAC4	Q86UU9	113 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SIX5	Q8N196	739 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	P2RY11	Q96G91	374 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CHP1	Q99653	195 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	PATJ	Q8NI35	1801 aa		12	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134		A0A0A0MRY4	1105 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	IRAK2	O43187	625 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	ADCY5	O95622	1261 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	NFATC1	O95644	943 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CYP17A1	P05093	508 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TPM1	P09493	284 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	KRT3	P12035	628 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	GJA4	P35212	333 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	IFNAR2	P48551	515 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	CXCR3	P49682	368 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	TBX4	P57082	545 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TMA16-208	ENST00000513134	FZD5	Q13467	585 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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