RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511376.5

FIP1L1-210, Transcript of factor interacting with PAPOLA and CPSF1, human

TSL 5

Gene FIP1L1, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FIP1L1-210	ENST00000511376	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TRAK2	O60296	914 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ITGAV	P06756	1048 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	GAP43	P17677	238 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ABCB4	P21439	1286 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	MYH11	P35749	1972 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CTSK	P43235	329 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ME1	P48163	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	C21orf59	P57076	290 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	GTF2B	Q00403	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	KLK10	O43240	276 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	PPP1R37	O75864	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CLDN6	P56747	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ALCAM	Q13740	583 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TSC1	Q92574	1164 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	3e-6	■■■■■ 28.8
FIP1L1-210	ENST00000511376	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.76	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376		A0A1W2PQ27	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376		A0A1W2PQ64	194 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376		K7ENM7	598 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CMA1	P23946	247 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CD27	P26842	260 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	DGKG	P49619	791 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	E2F1	Q01094	437 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	IL9R	Q01113	521 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	AMPD3	Q01432	767 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.75	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	MYLK	Q15746	1914 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376		K7ENP7	123 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	KCNK3	O14649	394 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TRIM24	O15164	1050 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	VILL	O15195	856 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	IL18RAP	O95256	599 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TYR	P14679	529 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	USP46	P62068	366 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	TAF10	Q12962	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	SFR1	Q86XK3	245 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	PDILT	Q8N807	584 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	WASH3P	C4AMC7	463 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	GABRD	O14764	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FIP1L1-210	ENST00000511376	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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