RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	GFRA2	O00451	464 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LATS1	O95835	1130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	NTSR1	P30989	418 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MPL	P40238	635 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	DGKG	P49619	791 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PDE4C	Q08493	712 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PMS2CL	Q68D20	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CPXM2	Q8N436	756 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	NAT16	Q8N8M0	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SGK1	O00141	431 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	GBP1	P32455	592 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	EFEMP1	Q12805	493 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CNGA2	Q16280	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	STX1A	Q16623	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MEA1	Q16626	185 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	IL31	Q6EBC2	164 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM270	Q6UE05	265 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF139	Q8WU17	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	GOLGA1	Q92805	767 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	WBP2	Q969T9	261 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	THAP9	Q9H5L6	903 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO10	Q9UK96	956 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		12.81	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MDM4	O15151	490 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ADAM23	O75077	832 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF217	O75362	1048 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO21	O94952	628 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CAVIN2	O95810	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXB2	P14652	356 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXC13	P31276	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXD12	P35452	270 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	P2RY2	P41231	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LRMP	Q12912	555 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	HSFY1	Q96LI6	401 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC12A8	A0AV02	714 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MED7	O43513	233 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TIMM44	O43615	452 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CISD3	P0C7P0	127 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	CREB5	Q02930	508 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	TYRO3	Q06418	890 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ABCC3-208	ENST00000506464	EMC10	Q5UCC4	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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