RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PRRX2Q99811 253 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RBSNQ9H1K0 784 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ECT2Q9H8V3 914 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 20.5
SH3BP2-208ENST00000504294 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.029e-6■■■■□ 24.8
SH3BP2-208ENST00000504294 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO10Q9HD67 2058 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 IRAK2O43187 625 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DAB1O75553 588 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GABBR2O75899 941 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 STC2O76061 302 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 APOEP02649 317 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ERBB2P04626 1255 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GYPCP04921 128 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MYBL1P10243 752 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF1P10914 325 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRNB2P17787 502 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CASP14P31944 242 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TBX4P57082 545 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC32Q14392 662 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EML3Q32P44 896 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF6Q58WW2 860 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 XYLT1Q86Y38 959 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL6Q8N531 539 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOOQ9BVL4 669 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EBF3Q9H4W6 596 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SIT1Q9Y3P8 196 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RTN2O75298 545 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCB4P21439 1286 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CCR1P32246 355 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PGFP49763 221 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO43Q4G163 708 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB106AQ8N104 65 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CPXM2Q8N436 756 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FLCNQ8NFG4 579 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC4CQ8WTT0 213 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF34Q969K3 372 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 19.7
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DEF6Q9H4E7 631 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SPHK2Q9NRA0 654 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 OBSL1O75147 1896 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf42Q9H799 3197 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KRBA1A5PL33 1030 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HMBSP08397 361 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ADH5P11766 374 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT3P12035 628 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DRD1P21728 446 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CTHP32929 405 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZXDBP98169 803 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ARID5BQ14865 1188 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DHCR24Q15392 516 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZNB5 142 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf20Q8ND61 904 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 BTN2A3PQ96KV6 586 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC7Q99615 494 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms