RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 STRIP2Q9ULQ0 834 aa20.32■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.29■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa20.29■□□□□ 0.84
USP40-217ENST00000496298 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.29■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 DGKGP49619 791 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.28■□□□□ 0.84
USP40-217ENST00000496298 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.28■□□□□ 0.84
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USP40-217ENST00000496298 NETO1Q8TDF5 533 aa20.26■□□□□ 0.83
USP40-217ENST00000496298 STK32AQ8WU08 396 aa20.26■□□□□ 0.83
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USP40-217ENST00000496298 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.26■□□□□ 0.83
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