RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484897.3

RPSAP58-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 58, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP58, Length 888 nt, Biotype processed pseudogene, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 P2RY11Q96G91 374 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 HSFY1Q96LI6 401 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FAM81BQ96LP2 452 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SEMA4AQ9H3S1 761 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ABCC13Q9NSE7 274 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ANO10Q9NW15 660 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FANCLQ9NW38 375 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DEC1Q9P2X7 70 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.63□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TBC1D3BA6NDS4 549 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 E5RJQ4 531 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 HRO43593 1189 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 LTFP02788 710 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 GRIA2P42262 883 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KLK7P49862 253 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KRT31Q15323 416 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 LONP2Q86WA8 852 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ALLCQ8N6M5 410 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 GOLGA1Q92805 767 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ACDQ96AP0 544 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DCLK3Q9C098 648 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 NCDNQ9UBB6 729 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CACNG3O60359 315 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TSPAN3O60637 253 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FBXO21O94952 628 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 NCAM1P13591 858 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CLCN1P35523 988 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 WASP42768 502 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PTK2Q05397 1052 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TYRO3Q06418 890 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PDCLQ13371 301 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CEP68Q76N32 757 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SYT13Q7L8C5 426 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SCML4Q8N228 414 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TERB1Q8NA31 727 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ADAM32Q8TC27 787 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 IRGQQ8WZA9 623 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PLD4Q96BZ4 506 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 EPC1Q9H2F5 836 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 MARK1Q9P0L2 795 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 RAB23Q9ULC3 237 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa11.61□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 THADAQ6YHU6 1953 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 SGK1O00141 431 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 APBB3O95704 486 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 FYNP06241 537 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TPM2P07951 284 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KRT9P35527 623 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 CHKAP35790 457 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ACADSBP45954 432 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 HARS2P49590 506 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DGKGP49619 791 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 DGKEP52429 567 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 MYL5Q02045 173 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TAF3Q5VWG9 929 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 ANO7Q6IWH7 933 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.6□□□□□ -0.55
RPSAP58-201ENST00000484897 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms