RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 AAASQ9NRG9 546 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 EURLQ9NYK6 297 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CLDN5O00501 218 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 TTI1O43156 1089 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC89Q8N998 374 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 E7ENQ6 273 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 HOXA9P31269 272 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MAP3K7CLP57077 242 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 PLD1Q13393 1074 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 C2CD6Q53TS8 623 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 RTP2Q5QGT7 225 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 F8W810 466 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 CASP8Q14790 479 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TPSAB1Q15661 275 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CROCCP2Q86T23 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 NLRP14Q86W24 1093 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 EMC1Q8N766 993 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 HDAC11Q96DB2 347 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC3Q9BY71 257 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 AMACRQ9UHK6 382 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 CHADO15335 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TADA2AO75478 443 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SUN1O94901 812 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 CTSAP10619 480 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 RARGP13631 454 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PSMA3P25788 255 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 GALNT2Q10471 571 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SLMAPQ14BN4 828 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRKCI-202ENST00000476635 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 TDRPQ86YL5 185 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC45Q96CN5 670 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SCLYQ96I15 445 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF558Q96NG5 402 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB11Q96P15 392 aa6.7□□□□□ -1.34
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