RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 CREG2Q8IUH2 290 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CCDC185Q8N715 623 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TEKT4Q8WW24 435 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 RAPGEF5Q92565 580 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 I6L893 689 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 F9P00740 461 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TUBP50607 506 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ARSEP51690 589 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 HYAL1Q12794 435 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 NNTQ13423 1086 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TUBB2AQ13885 445 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CA9Q16790 459 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ELMOD1Q8N336 334 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 EXD1Q8NHP7 514 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 NTAN1Q96AB6 310 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 MS4A14Q96JA4 679 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SERPINB11Q96P15 392 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 COX16Q9P0S2 106 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 FZD10Q9ULW2 581 aa14.8□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 C2orf78A6NCI8 922 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 COCHO43405 550 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CEP104O60308 925 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 GLP2RO95838 553 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 IGLV3-27P01718 113 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 GABRR2P28476 465 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 GBP1P32455 592 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CCR2P41597 374 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SCAPQ12770 1279 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 EFEMP1Q12805 493 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 BOLA3Q53S33 107 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 HECTD3Q5T447 861 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 FAM71BQ8TC56 605 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 HSPH1Q92598 858 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SLC39A13Q96H72 371 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CORO1BQ9BR76 489 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ASAH2Q9NR71 780 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 DPP7Q9UHL4 492 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.79□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 LRRD1A4D1F6 860 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 XYLBO75191 536 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 MOSPD3O75425 235 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 OLFM2O95897 454 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 MYL4P12829 197 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 KDELR1P24390 212 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CDC25CP30307 473 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ADRA1BP35368 520 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 CYP4F8P98187 520 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 TAZQ16635 292 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.78□□□□□ -0.04
HPS1-209ENST00000470095 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms