RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PNPOQ9NVS9 261 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR6B1O95007 311 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC1A6P48664 564 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CRADDP78560 199 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FSTL1Q12841 308 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MMEL1Q495T6 779 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SATL1Q86VE3 508 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HPS6Q86YV9 775 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GMLQ99445 158 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OGTO15294 1046 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIN3BO75182 1162 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PGM3O95394 542 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 METTL18O95568 372 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNNC2P02585 160 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HOXC6P09630 235 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADORA2AP29274 412 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RANBP1P43487 201 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM47CQ5HY64 1035 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 AAGABQ6PD74 315 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BIRC5O15392 142 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MSCO60682 206 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 UQCRBP14927 111 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAG1P15918 1043 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VCLP18206 1134 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPD1P21695 349 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CASC4Q6P4E1 433 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM83AQ86UY5 434 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OLFM3Q96PB7 478 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM134Q9H6X4 195 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 APOL1O14791 398 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRKG1Q13976 671 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RABGAP1LQ5R372 815 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAVSQ7Z434 540 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDHR1Q96JP9 859 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CDH22Q9UJ99 828 aa14.9□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM159BA6NKW6 160 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PYGLP06737 847 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAP3K10Q02779 954 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CA9Q16790 459 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MBLAC2Q68D91 279 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARCQ7LC44 396 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM192Q8IY95 271 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PQLC3Q8N755 202 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NAT14Q8WUY8 206 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GCNAQ96QF7 691 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MKS1Q9NXB0 559 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EMCNQ9ULC0 261 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 WNT10BO00744 389 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GSRP00390 522 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL4RP24394 825 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDK3Q15120 406 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZPBP2Q6X784 338 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RNF149Q8NC42 400 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CNPY3Q9BT09 278 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 POMPQ9Y244 141 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TPP1O14773 563 aa14.89□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms