RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 CCDC40Q4G0X9 1142 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 PIGKQ92643 395 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 TCEAL3Q969E4 200 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.9■□□□□ 0.14
HERC3-206ENST00000431413 BICDL2A1A5D9 508 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GFRA2O00451 464 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TRIM24O15164 1050 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 AP5Z1O43299 807 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ZNF217O75362 1048 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 HMBSP08397 361 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 WASP42768 502 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FMO5P49326 533 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PDE4CQ08493 712 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LRMPQ12912 555 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 RNF139Q8WU17 664 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 UCMAQ8WVF2 138 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 BHMTQ93088 406 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PLD4Q96BZ4 506 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NT5C1BQ96P26 610 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PLK2Q9NYY3 685 aa15.89■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SLC12A8A0AV02 714 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PRRT4C9JH25 899 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TM4SF5O14894 197 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NPC1O15118 1278 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PMM2O15305 246 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 KLKB1P03952 638 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PAEPP09466 180 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CISD3P0C7P0 127 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SETSIPP0DME0 302 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GABRG2P18507 467 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LMAN2Q12907 356 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ISM2Q6H9L7 571 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TMEM270Q6UE05 265 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SYT12Q8IV01 421 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 DENND1CQ8IV53 801 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GABRG3Q99928 467 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FBXO10Q9UK96 956 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.88■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LNP1A1A4G5 178 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 C4orf47A7E2U8 309 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 P4HA2O15460 535 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 HOXD12P35452 270 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ZNF445P59923 1031 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 STARD3Q14849 445 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 STILQ15468 1287 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ARMCX6Q7L4S7 300 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CPXM2Q8N436 756 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TMEM9BQ9NQ34 198 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.87■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PQF6 199 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 O00370 1275 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 GNA14O95837 355 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 PTGER3P43115 390 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ZNF132P52740 706 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ADIGQ0VDE8 80 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 TRIM61Q5EBN2 209 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FYB2Q5VWT5 728 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 LCLAT1Q6UWP7 414 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 FRMD1Q8N878 549 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CEP76Q8TAP6 659 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 UBA3Q8TBC4 463 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 DDI1Q8WTU0 396 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 NELFBQ8WX92 580 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 ACOX2Q99424 681 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HERC3-206ENST00000431413 HCN2Q9UL51 889 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms