RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	GABRB2	P47870	512 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SOX9	P48436	509 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	UBXN1	Q04323	297 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ARC	Q7LC44	396 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TULP2	O00295	520 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	HSF2BP	O75031	334 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF1	P10914	325 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP11B1	P15538	503 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	C11orf74	Q86VG3	221 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160		E7ENQ6	273 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LILRB5	O75023	590 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DAB1	O75553	588 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RGS7	P49802	495 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MTAP	Q13126	283 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FER	P16591	822 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC11A2	P49281	568 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PGF	P49763	221 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO10	Q9UK96	956 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EGF	P01133	1207 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CDR2	Q01850	454 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IQCB1	Q15051	598 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SYCP1	Q15431	976 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EOGT	Q5NDL2	527 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NUP58	Q9BVL2	599 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.48	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC28	Q96AY4	2481 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TBX18	O95935	607 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CD72	P21854	359 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TBX4	P57082	545 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CDK17	Q00537	523 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC8	Q8TAM2	541 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A1B0GTH6	734 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160		E5RJQ4	531 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CAPN9	O14815	690 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TIMM44	O43615	452 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GABBR2	O75899	941 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GFRA2	O00451	464 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	KAT7	O95251	611 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	APOE	P02649	317 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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