RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 GPC5P78333 572 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IRF7Q92985 503 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PLD4Q96BZ4 506 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SERPINB11Q96P15 392 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 BRD9Q9H8M2 597 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IGLV3-25P01717 112 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IRF1P10914 325 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 RRM1P23921 792 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GBP1P32455 592 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PFKPQ01813 784 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 RING1Q06587 406 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PDGFRLQ15198 375 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 NT5C3BQ969T7 300 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 OTUB2Q96DC9 234 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 NPY6RQ99463 290 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PARVAQ9NVD7 372 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GREM1O60565 184 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GSDMDP57764 484 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GSE1Q14687 1217 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 UNC45BQ8IWX7 931 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TTC16Q8NEE8 873 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 DNASE1L2Q92874 299 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 WBP2Q969T9 261 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD62A6NC57 917 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 DCXO43602 365 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IGLV3-27P01718 113 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 HMBSP08397 361 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 FLT3P36888 993 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IFNAR2P48551 515 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 HARS2P49590 506 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TBX4P57082 545 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ZXDAP98168 799 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 Q6ZNB5 142 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TAC4Q86UU9 113 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 JOSD2Q8TAC2 188 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ZNF653Q96CK0 615 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SLC39A13Q96H72 371 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 M0QYT0 321 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ARNTLO00327 626 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 IRAK2O43187 625 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 F9P00740 461 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 KLKB1P03952 638 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ALADP13716 330 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PDGFRAP16234 1089 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 GALCP54803 685 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 MAMLD1Q13495 774 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 EML3Q32P44 896 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 TRNP1Q6NT89 227 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ADAM32Q8TC27 787 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ATP2A3Q93084 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 AZIN2Q96A70 460 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ASIC4Q96FT7 647 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 WNT16Q9UBV4 365 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 SCINQ9Y6U3 715 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-211ENST00000424766 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 ENDOD1O94919 500 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 GJB6O95452 261 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-211ENST00000424766 LATS1O95835 1130 aa21.45■■□□□ 1.02
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