RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 RARGP13631 454 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 KDELR1P24390 212 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PPP3CCP48454 512 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CXCR3P49682 368 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 RGS19P49795 217 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PDK2Q15119 407 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R5EQ16537 467 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 KCTD6Q8NC69 237 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 NTAN1Q96AB6 310 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SERPINB11Q96P15 392 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TADA3O75528 432 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CDKN2BP42772 138 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TFDP3Q5H9I0 405 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 VSIG1Q86XK7 387 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC185Q8N715 623 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CASP10Q92851 521 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 FZD10Q9ULW2 581 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ARSEP51690 589 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CDH6P55285 790 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SCAPQ12770 1279 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 NNTQ13423 1086 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 DPYSL2Q16555 572 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TAZQ16635 292 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 FAM71BQ8TC56 605 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 KRIT1O00522 736 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TUBB4BP68371 445 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ELMOD1Q8N336 334 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC188H7C350 402 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TLR5O60602 858 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ADRA1BP35368 520 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TUBP50607 506 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 KRT81Q14533 505 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 EFHC2Q5JST6 749 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TIFAQ96CG3 184 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 WDCPQ9H6R7 721 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 DPP7Q9UHL4 492 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 OBSL1O75147 1896 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF487B1APH4 448 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 ZMYND10O75800 440 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CD48P09326 243 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 HOXA9P31269 272 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 L1CAMP32004 1257 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 C2orf54Q08AI8 447 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 DPYSL3Q14195 570 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CA9Q16790 459 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 RNF34Q969K3 372 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CALN1Q9BXU9 219 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 PRO3102Q9H379 93 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC71-201ENST00000321895 MSI1O43347 362 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 TJP3O95049 919 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 CCR1P32246 355 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 EFEMP1Q12805 493 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R5DQ14738 602 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CCDC71-201ENST00000321895 HECTD3Q5T447 861 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms