RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294172.6

NXF1-201, Transcript of nuclear RNA export factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXF1, Length 2,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1-201ENST00000294172 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ARL4AP40617 200 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 IL9RQ01113 521 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 NETO2Q8NC67 525 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CFAP36Q96G28 342 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SYT15Q9BQS2 421 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CHST12Q9NRB3 414 aa14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ZNF487B1APH4 448 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 H0YHG0 523 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 AP1G2O75843 785 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CA4P22748 312 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CD52P31358 61 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ADAM32Q8TC27 787 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SGSM3Q96HU1 749 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 MAGEB18Q96M61 343 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KCNK16Q96T55 309 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FZD10Q9ULW2 581 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 HTTP42858 3142 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.51□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 F5H423 210 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 I3L4J1 428 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CAPN9O14815 690 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GPR182O15218 404 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CREB3O43889 395 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SNX3O60493 162 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 DAB1O75553 588 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ASGR1P07306 291 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GHRP10912 638 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 LHX1P48742 406 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 NR2C2P49116 596 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PCED1BQ96HM7 432 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CYTH2Q99418 400 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 DTLQ9NZJ0 730 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SENP1Q9P0U3 644 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GOLGA8RI6L899 631 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 NRP1O14786 923 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 9.9
NXF1-201ENST00000294172 SEPT4O43236 478 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CA12O43570 354 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 METTL18O95568 372 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 POMCP01189 267 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FOXN2P32314 431 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 NOS2P35228 1153 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PRKCZQ05513 592 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ITIH4Q14624 930 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 VPS52Q8N1B4 723 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CCT6BQ92526 530 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ULBP1Q9BZM6 244 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 PADI3Q9ULW8 664 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.5□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 DNM1LO00429 736 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 ASMTLO95671 621 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CACNA2D1P54289 1103 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 DEUP1Q05D60 604 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 XRCC4Q13426 336 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 RASA2Q15283 850 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KCNA10Q16322 511 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FAM35AQ86V20 835 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 LGMNQ99538 433 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 FETUBQ9UGM5 382 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GGT7Q9UJ14 662 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.49□□□□□ -0.09
NXF1-201ENST00000294172 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms