RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MON1AQ86VX9 555 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FUT8Q9BYC5 575 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 USP18Q9UMW8 372 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR2E1Q9Y466 385 aa24.86■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CBX1P83916 185 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BNIPLQ7Z465 357 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAC4Q86UU9 113 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HINFPQ9BQA5 517 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GDF3Q9NR23 364 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIGVQ9NUD9 493 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SZT2Q5T011 3432 aa24.85■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MDM4O15151 490 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RFPL2O75678 378 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBX18O95935 607 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAATS1Q7Z4T9 603 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM131BQ86XD5 332 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CASP10Q92851 521 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSH1P0DML2 217 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSH2P0DML3 217 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPHB3P54753 998 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ACAP1Q15027 740 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HDXQ7Z353 690 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC185Q8N715 623 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.84■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYO9BQ13459 2157 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCL16O15467 120 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MSI1O43347 362 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCK1P35558 622 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GUCY2DQ02846 1103 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VEPH1Q14D04 833 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAPGEF5Q92565 580 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HSPH1Q92598 858 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMG2Q969U7 264 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCSER2Q9H7U1 834 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DDIT4Q9NX09 232 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAFFQ9ULX9 164 aa24.83■■□□□ 1.57
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.83■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYBL2P10244 700 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RARAP10276 462 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RARGP13631 454 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEUP1Q05D60 604 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC38Q5VT99 294 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STRADAQ7RTN6 431 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COMMD8Q9NX08 183 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENDOD1O94919 500 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRG1P02750 347 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAF12Q16514 161 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CA9Q16790 459 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYRFLQ96LU7 910 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AMACRQ9UHK6 382 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa24.82■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 I6L893 689 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP2K7O14733 419 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRPSAP2O60256 369 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PHF2O75151 1096 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SASH3O75995 380 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT1P04264 644 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CD48P09326 243 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRIP1P48552 1158 aa24.81■■□□□ 1.56
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms