RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	LAYN	Q6UX15	382 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ALLC	Q8N6M5	410 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TBCB	Q99426	244 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP41	Q9BYV8	373 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PRRG1	O14668	218 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PLA2G6	O60733	806 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	THRA	P10827	490 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MFSD10	Q14728	455 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HMGCR	P04035	888 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ACADS	P16219	412 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HIST1H2AD	P20671	130 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	FAR2	Q96K12	515 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CXCL11	O14625	94 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MGAT1	P26572	445 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CHKA	P35790	457 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TNFSF9	P41273	254 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC19	Q9H756	370 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023		E5RJQ4	531 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NOL4	O94818	638 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ALAD	P13716	330 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CPA3	P15088	417 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	AMPD1	P23109	780 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ADORA2A	P29274	412 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SOX11	P35716	441 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MGAT5	Q09328	741 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.72	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023		H7C4K7	107 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	APOC2	P02655	101 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CHRM3	P20309	590 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	VGLL4	Q14135	290 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	CPNE1	Q99829	537 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023		F5H5T6	163 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NCAM2	O15394	837 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GRIN3B	O60391	1043 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	B3GAT3	O94766	335 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	HDAC4	P56524	1084 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	GPC2	Q8N158	579 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.71	□□□□□ -0.53
AKAP9-216	ENST00000619023	AXL	P30530	894 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	AKT1	P31749	480 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CNGA2	Q16280	664 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
AKAP9-216	ENST00000619023	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		11.71	□□□□□ -0.54

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