RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615198.4

CPEB1-211, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-211ENST00000615198 C7orf26Q96N11 449 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TBCBQ99426 244 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 H7C0C1 242 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 COPEO14579 308 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CA12O43570 354 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 HBP1O60381 514 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 STAG3L1P0CL83 205 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ATP6V1C1P21283 382 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 BGNP21810 368 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ATP5OP48047 213 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NOGQ13253 232 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KYAT1Q16773 422 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MORN1Q5T089 497 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KIRREL3Q8IZU9 778 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MAML3Q96JK9 1138 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PLLPQ9Y342 182 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 IQCF3P0C7M6 154 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ABL2P42684 1182 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MAGEA3P43357 314 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 STILQ15468 1287 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 EFCAB12Q6NXP0 572 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 DPP9Q86TI2 863 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TTC8Q8TAM2 541 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 COPS5Q92905 334 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TTC17Q96AE7 1141 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MTBPQ96DY7 904 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KATNBL1Q9H079 304 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KLC2Q9H0B6 622 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 STOML1Q9UBI4 398 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.05■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 APOL1O14791 398 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GYG2O15488 501 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KCNN4O15554 427 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 AVILO75366 819 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ACADSP16219 412 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZBTB16Q05516 673 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PQLC3Q8N755 202 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 HPDLQ96IR7 371 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 A6NHS1 94 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 E5RJQ4 531 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MDM4O15151 490 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GJB1P08034 283 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PFKMP08237 780 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 RARBP10826 455 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MYL2P10916 166 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CYP3A5P20815 502 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PHKA2P46019 1235 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 BCAR1P56945 870 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KRT81Q14533 505 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 AMHR2Q16671 573 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CCDC14Q49A88 953 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZNF670Q9BS34 389 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.04■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 RFPL1O75677 317 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZBED1O96006 694 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 APOEP02649 317 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NEFHP12036 1026 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NDST1P52848 882 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CCL14Q16627 93 aa16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms