RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591367.5

C18orf8-210, Transcript of Uncharacterized protein C18orf8, human

TSL 3

Gene C18orf8, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C18orf8-210	ENST00000591367	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367		A0A1W2PPL8	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TISP43	B9A030	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367		B9A039	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367		H0Y626	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	DOK2	O60496	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	AGFG2	O95081	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ABHD16A	O95870	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	AHSG	P02765	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ADRB2	P07550	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SFTPC	P11686	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CKB	P12277	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CNTF	P26441	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HOXD13	P35453	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HSPA7	P48741	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TUB	P50607	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TAF5	Q15542	800 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	MAML1	Q92585	1016 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HTRA1	Q92743	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	COG5	Q9UP83	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.88	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	FYB1	O15117	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PLA2G6	O60733	806 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	USP1	O94782	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	PRSS23	O95084	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	CHEK2	O96017	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GNAI2	P04899	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	KRT13	P13646	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TSHR	P16473	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	NR4A1	P22736	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SERPINF1	P36955	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SOX8	P57073	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	NOMO3	P69849	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TFCP2	Q12800	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	KRT32	Q14532	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RASA2	Q15283	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	BICD1	Q96G01	975 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
C18orf8-210	ENST00000591367	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms