RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ASAH2Q9NR71 780 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 RAD18Q9NS91 495 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 SRPK3Q9UPE1 567 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 LRRK2Q5S007 2527 aa5.64□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ITPR2Q14571 2701 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF445P59923 1031 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 BPIFB1Q8TDL5 484 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 NLRP4Q96MN2 994 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa5.63□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.63□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.62□□□□□ -1.51
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TRIM25-208ENST00000574234 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 KSR1Q8IVT5 923 aa5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 TPH2Q8IWU9 490 aa5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 NXPE1Q8N323 547 aa5.62□□□□□ -1.51
TRIM25-208ENST00000574234 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.62□□□□□ -1.51
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