RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552548.5

PFDN5-217, Transcript of prefoldin subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene PFDN5, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5-217ENST00000552548 STK32AQ8WU08 396 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 MYRFLQ96LU7 910 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 WDR24Q96S15 920 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 KXD1Q9BQD3 176 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 PIDD1Q9HB75 910 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 CD320Q9NPF0 282 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PFDN5-217ENST00000552548 EYSQ5T1H1 3165 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ATP8B3O60423 1300 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SLC12A8A0AV02 714 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ANKRD62A6NC57 917 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 M0QYT0 321 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TRIM24O15164 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PJA2O43164 708 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MBTPS2O43462 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TLR5O60602 858 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 DAB1O75553 588 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PALMO75781 387 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ASGR2P07307 311 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CSH1P0DML2 217 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CSH2P0DML3 217 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 KRT3P12035 628 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 BMP1P13497 986 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PDGFRAP16234 1089 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PTPN2P17706 415 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 COMTP21964 271 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FSHRP23945 695 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PSMA2P25787 234 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 HOXC13P31276 330 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SLC6A4P31645 630 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CREMQ03060 361 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ADCY2Q08462 1091 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MMRN1Q13201 1228 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 GRM2Q14416 872 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 STILQ15468 1287 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 RFWD3Q6PCD5 774 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 BNIPLQ7Z465 357 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 KIAA1328Q86T90 577 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FAM131BQ86XD5 332 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 LRRC57Q8N9N7 239 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 C3orf20Q8ND61 904 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SUSD6Q92537 303 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FGF13Q92913 245 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 BHMTQ93088 406 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 IQCDQ96DY2 449 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PSMB7Q99436 277 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NPY6RQ99463 290 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ZWILCHQ9H900 591 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CD207Q9UJ71 328 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CPQQ9Y646 472 aa7.39□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 CLUHO75153 1309 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 ENC1O14682 589 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TSPAN3O60637 253 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 SRGAP2O75044 1071 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 LRCH4O75427 683 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 PAPLNO95428 1278 aa7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PFDN5-217ENST00000552548 IGLV3-25P01717 112 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms