RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CHEK2O96017 543 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SLC1A1P43005 524 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CYP2J2P51589 502 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CARTPTQ16568 116 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 DPH6Q7L8W6 267 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TTC8Q8TAM2 541 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 KLRG1Q96E93 195 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 HK2P52789 917 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GCNT1Q02742 428 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 FAR2Q96K12 515 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 NAMPTP43490 491 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SMU1Q2TAY7 513 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 TLR10Q9BXR5 811 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 VPS39Q96JC1 886 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 GINS4Q9BRT9 223 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 CHID1Q9BWS9 393 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 CEP170P1Q96L14 293 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRD-214ENST00000540109 AGPAT1Q99943 283 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 NUP85Q9BW27 656 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-214ENST00000540109 GIN1Q9NXP7 522 aa6.25□□□□□ -1.41
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