RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531440.5

RNF170-208, Transcript of ring finger protein 170, human

TSL 4

Gene RNF170, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF170-208	ENST00000531440	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440		J3QKU1	62 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GAP43	P17677	238 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ITPKB	P27987	946 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DDIT3	P35638	169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CCT8	P50990	548 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TPMT	P51580	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ALCAM	Q13740	583 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TEAD4	Q15561	434 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	BAP1	Q92560	729 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ATM	Q13315	3056 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MGA	Q8IWI9	3026 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440		A0A1B0GVT2	93 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	WASH3P	C4AMC7	463 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PLK4	O00444	970 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IRF1	P10914	325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ACADM	P11310	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GRIA4	P48058	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KCNA1	Q09470	495 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ORC1	Q13415	861 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ENPP2	Q13822	863 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DHRS13	Q6UX07	377 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	IGSF8	Q969P0	613 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DFNA5	O60443	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GREM1	O60565	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TLR5	O60602	858 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GCNT3	O95395	438 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	BMP15	O95972	392 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SLC5A3	P53794	718 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TNNC1	P63316	161 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CFHR1	Q03591	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	WBP2	Q969T9	261 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440		A8MXQ7	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	C1S	P09871	688 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	JUP	P14923	745 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CDH8	P55286	799 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	CCDC157	Q569K6	752 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNF170-208	ENST00000531440	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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