RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527083.5

LINC00678-201, long intergenic non-protein coding RNA 678, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LINC00678, Length 786 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00678-201ENST00000527083 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.71□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.71□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.71□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SLC12A8A0AV02 714 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SMTNL1A8MU46 457 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 KCNJ18B7U540 433 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 O00370 1275 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RNF40O75150 1001 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 KAT7O95251 611 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 APBB3O95704 486 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 CCDC172P0C7W6 258 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 GNA15P30679 374 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HOXA6P31267 233 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 GBP1P32455 592 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DGKEP52429 567 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 ADIGQ0VDE8 80 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 KCNJ12Q14500 433 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SYCP1Q15431 976 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 STX1AQ16623 288 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 MEA1Q16626 185 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RAB41Q5JT25 222 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SYT13Q7L8C5 426 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SCML4Q8N228 414 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PLD4Q96BZ4 506 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 R4GN57 208 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PRR23AA6NEV1 266 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 BECN2A8MW95 431 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HHLA1C9JL84 531 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NPC1O15118 1278 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TIMM44O43615 452 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TBX18O95935 607 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 EGFP01133 1207 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 CYP17A1P05093 508 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HMBSP08397 361 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SLC2A3P11169 496 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DESP17661 470 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PON1P27169 355 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 FZD5Q13467 585 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 MPPE1Q53F39 396 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 C2orf27AQ580R0 203 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 FSTL4Q6MZW2 842 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PGBD3Q8N328 593 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NAT16Q8N8M0 369 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 LMO3Q8TAP4 145 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DDI1Q8WTU0 396 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 CHFRQ96EP1 664 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 NOTCH4Q99466 2003 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 AXIN1O15169 862 aa8.68□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 IRAK2O43187 625 aa8.68□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 RHOBTB1O94844 696 aa8.68□□□□□ -1.02
LINC00678-201ENST00000527083 LATS1O95835 1130 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms