RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 LMO2P25791 158 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HOXA6P31267 233 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 AMPD2Q01433 879 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MTF1Q14872 753 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PDGFRLQ15198 375 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CSRP2Q16527 193 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MEA1Q16626 185 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SGO2Q562F6 1265 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ACOT1Q86TX2 421 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC8AQ8IWT6 810 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 NETO1Q8TDF5 533 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC42Q96M95 316 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PHF12Q96QT6 1004 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 DEF6Q9H4E7 631 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 F5P12259 2224 aa11.94□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SOBPA7XYQ1 873 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 AXIN1O15169 862 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 RNF40O75150 1001 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ATP2C2O75185 946 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 EGFP01133 1207 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L7P0C7H9 530 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SKILP12757 684 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA13P27216 316 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 IFNAR2P48551 515 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CDR2Q01850 454 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CNGA2Q16280 664 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 WDR59Q6PJI9 974 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CPA6Q8N4T0 437 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CHFRQ96EP1 664 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYRFLQ96LU7 910 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TWNKQ96RR1 684 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A12Q96S37 553 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PKMYT1Q99640 499 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 AGPAT1Q99943 283 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 P2RY13Q9BPV8 354 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HESX1Q9UBX0 185 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.93□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ATP8B3O60423 1300 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 C2orf78A6NCI8 922 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 SLC30A4O14863 429 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 AKR1B10O60218 316 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GDF9O60383 454 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FECHP22830 423 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GALK1P51570 392 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ORC1Q13415 861 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC6Q16204 474 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1JQ5JR12 505 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HGSNATQ68CP4 663 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP17Q68EM7 881 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FAM171BQ6P995 826 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM72Q6ZMU5 477 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 GAB3Q8WWW8 586 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYLPFQ96A32 169 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 EXOC4Q96A65 974 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.58e-7■□□□□ 8.7
UBE2B-208ENST00000511807 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MED10Q9BTT4 135 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ECT2Q9H8V3 914 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 CEP83Q9Y592 693 aa11.92□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 MYH10P35580 1976 aa11.91□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
UBE2B-208ENST00000511807 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms