RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 NOS2P35228 1153 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 BCAR1P56945 870 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 GRIK3Q13003 919 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CENPUQ71F23 418 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM35AQ86V20 835 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 CENPTQ96BT3 561 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 RTP4Q96DX8 246 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM2Q99965 735 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MED10Q9BTT4 135 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 KRT82Q9NSB4 513 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 NOD1Q9Y239 953 aa8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CFAP69A5D8W1 941 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 E7ESA3 106 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 INPPL1O15357 1258 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 POMCP01189 267 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CYP11A1P05108 521 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ODC1P11926 461 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 COL6A1P12109 1028 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PAX3P23760 479 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2F1P24903 491 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PCSK1P29120 753 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SULT1E1P49888 294 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TKTL1P51854 596 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MAP3K7CLP57077 242 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HIF1AQ16665 826 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RAB41Q5JT25 222 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC185Q8N715 623 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PCED1BQ96HM7 432 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NPY6RQ99463 290 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC77Q9BR77 488 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZMYND15Q9H091 742 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 USP29Q9HBJ7 922 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 EURLQ9NYK6 297 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 H7C0C1 242 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 M0QZQ0 153 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CDH16O75309 829 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 AP1G2O75843 785 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO21O94952 628 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5OP48047 213 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFV1P49821 464 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TUSC3Q13454 348 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF6Q58WW2 860 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RNF169Q8NCN4 708 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 UROC1Q96N76 676 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SMOQ99835 787 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RTP3Q9BQQ7 232 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ACBD6Q9BR61 282 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FZD10Q9ULW2 581 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 HEY1Q9Y5J3 304 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 USP3Q9Y6I4 520 aa8.52□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 E7EVH7 732 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFAB1O14561 156 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC3O43617 180 aa8.51□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM63AO94886 807 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms