RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 RENBPP51606 427 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DGKQP52824 942 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 E2F1Q01094 437 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 BIRC3Q13489 604 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 POSTNQ15063 836 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TOR3AQ9H497 397 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 NFU1Q9UMS0 254 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 LINC00473A8K010 186 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 AP4M1O00189 453 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 QSOX1O00391 747 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS11DO60235 418 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TAF5LO75529 589 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 HSD3B1P14060 373 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 JUPP14923 745 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CREB1P16220 341 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 KLRK1P26718 216 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CYP2C18P33260 490 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 GSTM5P46439 218 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ARL4CP56559 192 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 AP2B1P63010 937 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PPFIA1Q13136 1202 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 GRM4Q14833 912 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DENND2CQ68D51 928 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CCDC70Q6NSX1 233 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 Q6ZPA2 131 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ZNF627Q7L945 461 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 OVCA2Q8WZ82 227 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 AMFRQ9UKV5 643 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.72□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CES2O00748 559 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 IRAK2O43187 625 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 NPSP0C0P6 89 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 EBLN1P0CF75 366 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 GYS1P13807 737 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ENGP17813 658 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 DRD1P21728 446 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ADRA1DP25100 572 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 AKT1P31749 480 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PNLIPRP1P54315 467 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 KCNJ12Q14500 433 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TIGD6Q17RP2 521 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 P3H1Q32P28 736 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TRIM60Q495X7 471 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 CLEC4GQ6UXB4 293 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 RUBCNQ92622 972 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 TTPALQ9BTX7 342 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 ZHX3Q9H4I2 956 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SAYSD1Q9NPB0 183 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SNX15Q9NRS6 342 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 SWAP70Q9UH65 585 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LZTS1Q9Y250 596 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 H0YIZ8 118 aa5.7□□□□□ -1.5
CCL20-204ENST00000489160 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms