RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACOT1Q86TX2 421 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NELFCDQ8IXH7 590 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHPFQ8IZ52 775 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C12orf29Q8N999 325 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CYLDQ9NQC7 956 aa15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 GFRA2O00451 464 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MDM4O15151 490 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DKK1O94907 266 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLKB1P03952 638 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYPP08247 313 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRIK2Q13002 908 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ORC1Q13415 861 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TRPC3Q13507 836 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TPGS1Q6ZTW0 290 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 GLRX5Q86SX6 157 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NAXDQ8IW45 347 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 LINC00301Q8NCQ3 95 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC2A14Q8TDB8 520 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BBS2Q9BXC9 721 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 IL21RQ9HBE5 538 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRT82Q9NSB4 513 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTPRBP23467 1997 aa15.07■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAP3K7CLP57077 242 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FUT11Q495W5 492 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SHC4Q6S5L8 630 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCD5Q86SK9 330 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MED10Q9BTT4 135 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DMAC2Q9NW81 257 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLK2Q9NYY3 685 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CD6P30203 668 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NDST1P52848 882 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASIC1P78348 528 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DLG4P78352 724 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCOA4Q13772 614 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NUDT18Q6ZVK8 323 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDZD3Q86UT5 571 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MDM1Q8TC05 714 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TNIP3Q96KP6 325 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TWNKQ96RR1 684 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CLEC4EQ9ULY5 219 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SCML2Q9UQR0 700 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.05■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1W2PQH9 124 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CYP26A1O43174 497 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PENKP01210 267 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 C7P10643 843 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PDCP20941 246 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 IL12RB1P42701 662 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DGKGP49619 791 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 GEN1Q17RS7 908 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF699Q32M78 642 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF667Q5HYK9 610 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FYB2Q5VWT5 728 aa15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms