RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474820.5

RBMS1-209, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 1 (best)

Gene RBMS1, Length 4,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820		A6NJR5	290 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TISP43	B9A030	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	LPXN	O60711	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	HOXC13	P31276	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	NUMB	P49757	651 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CRYM	Q14894	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	QPCT	Q16769	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ZNF394	Q53GI3	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	KRT37	O76014	449 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MICAL2	O94851	1124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ARIH2	O95376	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	F9	P00740	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GRK2	P25098	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PSMA2	P25787	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PTPN4	P29074	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CHKA	P35790	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	MNAT1	P51948	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ROR1	Q01973	937 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	IFT88	Q13099	833 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	UROC1	Q96N76	676 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	GABRD	O14764	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	TSPAN1	O60635	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	KRT38	O76015	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	F2	P00734	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PFKM	P08237	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBMS1-209	ENST00000474820	SLC26A3	P40879	764 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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