RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	COX16	Q9P0S2	106 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	FZD10	Q9ULW2	581 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	USP3	Q9Y6I4	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF487	B1APH4	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	APOL1	O14791	398 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	EFCAB14	O75071	495 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT14	P02533	472 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ATF2	P15336	505 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MAGEA11	P43364	429 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ARPP19	P56211	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	NME3	Q13232	169 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MFSD5	Q6N075	450 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	VSTM1	Q6UX27	236 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT222	Q8N1A0	295 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MREG	Q8N565	214 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ALLC	Q8N6M5	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	EDEM1	Q92611	657 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	FAF2	Q96CS3	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SNF8	Q96H20	258 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	C8orf48	Q96LL4	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF157	Q96PX1	679 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	FMO2	Q99518	471 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MTMR11	A4FU01	709 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFRSF10B	O14763	440 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MCF2L	O15068	1137 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGAV	P06756	1048 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ACR	P10323	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TGM2	P21980	687 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	L1CAM	P32004	1257 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR15	P49685	360 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	VPS41	P49754	854 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	AIF1	P55008	147 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PLTP	P55058	493 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	CALCOCO2	Q13137	446 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	GPS2	Q13227	327 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TAC4	Q86UU9	113 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	CCDC89	Q8N998	374 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ADAM32	Q8TC27	787 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	LRRC45	Q96CN5	670 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PIGV	Q9NUD9	493 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	DDIT4	Q9NX09	232 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	WHRN	Q9P202	907 aa		12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SGK1	O00141	431 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	TBC1D4	O60343	1298 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	EFEMP2	O95967	443 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	LAG3	P18627	525 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	IL4R	P24394	825 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	KLRC2	P26717	231 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	ARL4A	P40617	200 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SMARCB1	Q12824	385 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR17	Q13304	367 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMD5	Q16401	504 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.78	□□□□□ -0.36
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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