RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 DESP17661 470 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 PSEN1P49768 467 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 CDC23Q9UJX2 597 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ASB3Q9Y575 518 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 OBSL1O75147 1896 aa25.29■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 DOCK6Q96HP0 2047 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 HADHQ16836 314 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 POLNQ7Z5Q5 900 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 TAC4Q86UU9 113 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ITIH5Q86UX2 942 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 TLE6Q9H808 572 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZWILCHQ9H900 591 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 PIGVQ9NUD9 493 aa25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 TADA3O75528 432 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 RFPL2O75678 378 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZMYND10O75800 440 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 IGLV3-25P01717 112 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 RARGP13631 454 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 RWDD2BP57060 319 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 NME3Q13232 169 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 CASP10Q92851 521 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 NCAPGQ9BPX3 1015 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 CARD9Q9H257 536 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZNF576Q9H609 170 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 COX16Q9P0S2 106 aa25.27■■□□□ 1.64
NME4-209ENST00000460297 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PRPSAP2O60256 369 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DEUP1Q05D60 604 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DUSP6Q16828 381 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RTL10Q7L3V2 364 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CREG2Q8IUH2 290 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RNF139Q8WU17 664 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 KLHL11Q9NVR0 708 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DDIT4Q9NX09 232 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CCL16O15467 120 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 KRT7P08729 469 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PYGMP11217 842 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 NRIP1P48552 1158 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 AADACL2Q6P093 401 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 FAM131BQ86XD5 332 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MS4A14Q96JA4 679 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 PBKQ96KB5 322 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 LRRC3Q9BY71 257 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CCSER2Q9H7U1 834 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 IL21Q9HBE4 155 aa25.26■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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NME4-209ENST00000460297 TBX18O95935 607 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RARAP10276 462 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RALAP11233 206 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 CCDC185Q8N715 623 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.634e-18■■■■■ 191.3
NME4-209ENST00000460297 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PPC1 479 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 F11P03951 625 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TUBB2AQ13885 445 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TMC8Q8IU68 726 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa25.24■■□□□ 1.63
NME4-209ENST00000460297 MDM4O15151 490 aa25.23■■□□□ 1.63
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