RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 KBTBD6Q86V97 674 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MIB1Q86YT6 1006 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ALLCQ8N6M5 410 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 UBA3Q8TBC4 463 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 LOXL4Q96JB6 756 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MARK1Q9P0L2 795 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.21■■□□□ 1.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 O00370 1275 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBED1O96006 694 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 LMNB2Q03252 620 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 PKDCCQ504Y2 493 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RASSF3Q86WH2 238 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TFAP2BQ92481 460 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KAT5Q92993 513 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.2■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM24O15164 1050 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KLKB1P03952 638 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DGKEP52429 567 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 FOXK2Q01167 660 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 EFEMP1Q12805 493 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CSRP2Q16527 193 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KCTD13Q8WZ19 329 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 BBS2Q9BXC9 721 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC4Q9HBW1 653 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SGK1O00141 431 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNG3O60359 315 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SETSIPP0DME0 302 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TYRP14679 529 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 GCNT1Q02742 428 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CNGA2Q16280 664 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 EOGTQ5NDL2 527 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RRAGAQ7L523 313 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TERB1Q8NA31 727 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DCLK3Q9C098 648 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.18■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SDHBP21912 280 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 PLK5Q496M5 336 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SCML4Q8N228 414 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DCLK1O15075 740 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ADAM23O75077 832 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 EPN2O95208 641 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 HMBSP08397 361 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ADIGQ0VDE8 80 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ANO7Q6IWH7 933 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 MED15Q96RN5 788 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 TPSD1Q9BZJ3 242 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO10Q9UK96 956 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 HCN2Q9UL51 889 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 STRIP2Q9ULQ0 834 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 EML5Q05BV3 1969 aa25.16■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC12A8A0AV02 714 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ALDH1A2O94788 518 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CISD3P0C7P0 127 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 CHKAP35790 457 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 STILQ15468 1287 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 BSPRYQ5W0U4 402 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 PRR23CQ6ZRP0 262 aa25.15■■□□□ 1.62
PPP1CB-208ENST00000455580 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms