RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SHC4Q6S5L8 630 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 OSTM1Q86WC4 334 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NUP93Q8N1F7 819 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TTC8Q8TAM2 541 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC15Q8TF66 581 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MYLPFQ96A32 169 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNIP3Q96KP6 325 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CLIC6Q96NY7 704 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 THADAQ6YHU6 1953 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 BECN2A8MW95 431 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CYP17A1P05093 508 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SYPP08247 313 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ADH5P11766 374 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TNNC1P63316 161 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CREB5Q02930 508 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DHCR24Q15392 516 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ISM2Q6H9L7 571 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MIEF2Q96C03 454 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MARK1Q9P0L2 795 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 WASF3Q9UPY6 502 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KRT19P08727 400 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 YWHAQP27348 245 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRR-204ENST00000440835 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 GAB4Q2WGN9 574 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SDE2Q6IQ49 451 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 DYMQ7RTS9 669 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PIP4P1Q86T03 277 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 TTC39CQ8N584 583 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 FNBP1Q96RU3 617 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CACNA1BQ00975 2339 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRR-204ENST00000440835 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 LNP1A1A4G5 178 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 C4orf47A7E2U8 309 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 KAT7O95251 611 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 MYL1P05976 194 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 SERPINF2P08697 491 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 C7P10643 843 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 PAX7P23759 505 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 GBP1P32455 592 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 GPR15P49685 360 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 CLDN10P78369 228 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 HECTD3Q5T447 861 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 UNC93AQ86WB7 457 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 EPSTI1Q96J88 318 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PTPRR-204ENST00000440835 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.34□□□□□ -1.4
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