RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 TYRP14679 529 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 WASP42768 502 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 PLA2G4AP47712 749 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 MXI1P50539 228 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 SEMA4DQ92854 862 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 MARK1Q9P0L2 795 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 CETN3O15182 167 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 CACNG3O60359 315 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 KCNK5O95279 499 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 HOXB2P14652 356 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 PSEN1P49768 467 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 SCD5Q86SK9 330 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 MIB1Q86YT6 1006 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 HCN2Q9UL51 889 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 STX10O60499 249 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 RALAP11233 206 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 NTSR1P30989 418 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 CHPFQ8IZ52 775 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 TTC39CQ8N584 583 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 BHMTQ93088 406 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 CISHQ9NSE2 258 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 RAB20Q9NX57 234 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 USP3Q9Y6I4 520 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 NUP205Q92621 2012 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC189-201ENST00000433909 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 GABRG2P18507 467 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PMLP29590 882 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PTGER3P43115 390 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 IRX4P78413 519 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PNOCQ13519 176 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 SDE2Q6IQ49 451 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 Q6ZNB5 142 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PRRT4C9JH25 899 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 STC2O76061 302 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 DGKGP49619 791 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 SYT12Q8IV01 421 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ACOX2Q99424 681 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ARID3AQ99856 593 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 RMND1Q9NWS8 449 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PLK2Q9NYY3 685 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 A0A1W2PQF6 199 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 HMBSP08397 361 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 RAD23BP54727 409 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 EFEMP1Q12805 493 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PIGZQ86VD9 579 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF276Q8N554 614 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TATDN2Q93075 761 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TSG101Q99816 390 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 AP5Z1O43299 807 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 CISD3P0C7P0 127 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 DPP6P42658 865 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 PRCPP42785 496 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 SLC8A3P57103 927 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 COG7P83436 770 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 LMAN2Q12907 356 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC189-201ENST00000433909 ST3GAL2Q16842 350 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms