RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 RELL1Q8IUW5 271 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FAF2Q96CS3 445 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FOXP3Q9BZS1 431 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 KCNN4O15554 427 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 GOT1P17174 413 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TGM2P21980 687 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 BDNFP23560 247 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 RBL1P28749 1068 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NOS2P35228 1153 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 METTL23Q86XA0 190 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 OR10T2Q8NGX3 314 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCD1Q96GM5 515 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 USP29Q9HBJ7 922 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 RGS18Q9NS28 235 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN9O14815 690 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM63AO94886 807 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 AGTP01019 485 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FYNP06241 537 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SKIP12755 728 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 DAOAP59103 153 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 HIF1AQ16665 826 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FNBP1LQ5T0N5 605 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PCGF5Q86SE9 256 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NPY6RQ99463 290 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ETNK2Q9NVF9 386 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TBK1Q9UHD2 729 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TSC2P49815 1807 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 C9IYK1 514 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 AMPD1P23109 780 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 VEGFBP49765 207 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MSS51Q4VC12 460 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CENPUQ71F23 418 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CROCCP2Q86T23 111 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FZD10Q9ULW2 581 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ZBED1O96006 694 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SEC24CP53992 1094 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD5Q6N075 450 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NETO2Q8NC67 525 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NT5C3BQ969T7 300 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ACBD6Q9BR61 282 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 PIGVQ9NUD9 493 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SQORQ9Y6N5 450 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 HHLA1C9JL84 531 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 M0QZQ0 153 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 DDHD2O94830 711 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 GRK4P32298 578 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CYP11A1P05108 521 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 APLP1P51693 650 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 DEUP1Q05D60 604 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FAXCQ5TGI0 409 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 CEP128Q6ZU80 1094 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 VSIG1Q86XK7 387 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 EDEM1Q92611 657 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINB12Q96P63 405 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 A6NNZ2 444 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO21O94952 628 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 NCAM1P13591 858 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 RAB41Q5JT25 222 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-209ENST00000428120 FAM171BQ6P995 826 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms