RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SPARTQ8N0X7 666 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 RFKQ969G6 155 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 VPS51Q9UID3 782 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 DHHO43323 396 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 ITGA2BP08514 1039 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 PNLIPRP1P54315 467 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 BCAT1P54687 386 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 POLE2P56282 527 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 FHL3Q13643 280 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ATP1A4Q13733 1029 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CCNIQ14094 377 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ICE2Q659A1 982 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LVRNQ6Q4G3 990 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MLXIPQ9HAP2 919 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF69Q9UC07 566 aa3.36□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 FAM155BO75949 473 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 USP1O94782 785 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ACTL6BO94805 426 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ANXA6P08133 673 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 MAPK9P45984 424 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 GPS1Q13098 491 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TIGD6Q17RP2 521 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LRCH2Q5VUJ6 765 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC70Q6NSX1 233 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PRDM8Q9NQV8 689 aa3.35□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 RRN3Q9NYV6 651 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 DKK3Q9UBP4 350 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.35□□□□□ -1.87
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