RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417936.5

SH3BP5-205, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-205ENST00000417936 SYT12Q8IV01 421 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TERB1Q8NA31 727 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HMGB4Q8WW32 186 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PIGKQ92643 395 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC35C1Q96A29 364 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 WDR35Q9P2L0 1181 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ACACBO00763 2458 aa11.13□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF217O75362 1048 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 KRT37O76014 449 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 IRF1P10914 325 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CD58P19256 250 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PSEN1P49768 467 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MAP3K7CLP57077 242 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ENPEPQ07075 957 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 LRMPQ12912 555 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PAK1Q13153 545 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF394Q53GI3 561 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HTR3DQ70Z44 454 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZMIZ2Q8NF64 920 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CEP76Q8TAP6 659 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 KAT5Q92993 513 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SMOQ99835 787 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC32A1Q9H598 525 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CYLDQ9NQC7 956 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 RAB20Q9NX57 234 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SCML2Q9UQR0 700 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.12□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CACNG3O60359 315 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ADAM23O75077 832 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HOXB2P14652 356 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 NTSR1P30989 418 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PGFP49763 221 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MXI1P50539 228 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 INCA1Q0VD86 236 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MESP2Q0VG99 397 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 STIM1Q13586 685 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 E2F5Q15329 346 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 EMC10Q5UCC4 262 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 KRT39Q6A163 491 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TMEM25Q86YD3 366 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TTC39CQ8N584 583 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 NAT16Q8N8M0 369 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 LMO3Q8TAP4 145 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 RLN3Q8WXF3 142 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CEP63Q96MT8 703 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 BBS2Q9BXC9 721 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 MARK1Q9P0L2 795 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ZNF510Q9Y2H8 683 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SPTBN2O15020 2390 aa11.11□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 GFRA2O00451 464 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 TYRP14679 529 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ADORA2BP29275 332 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 GTF2H1P32780 548 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 PLA2G4AP47712 749 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 FMO5P49326 533 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 IRX4P78413 519 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 APBA1Q02410 837 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.1□□□□□ -0.63
SH3BP5-205ENST00000417936 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms